Pendidikan di Yogyakarta mendapat momen yang cukup signifikan tatkala Yogyakarta menjadi ibukota Republik Indonesia. Berkumpulnya tokoh-tokoh politik, cendekiawan dan pemuda di Yogyakarta mengilhami untuk membangun sebuah lembaga perguruan tinggi milik bangsa Indonesia yang akan sangat dibutuhkan bagi bangsa yang sedang membangun.Usaha itu dipelopori oleh Boediarso, Marsito, Prijono dan Soenarjo yang pada tanggal 24 Januari 1946 melakukan pembicaraan tentang rencana pembentukan sebuah badan penyelenggara pendidikan tinggi. Kemudian dibentuk panitia dengan ketua Ki Hajar Dewantara yang akhirnya berhasil membentuk Balai Perguruan Tinggi Gadjah Mada, nama yang diusulkan oleh Boediarto. Pendirian balai perguruan tinggi Gadjah Mada ini melibatkan mahasiswa-mahasiswa yang meninggalkan pelajarannya di Jakarta, Bogor, Bandung dan Surabaya. Balai perguruan Tinggi Gadjah Mada berhasil didirikan pada tanggal 3 Maret 1946, dan dikelola oleh yayasan swasta.