Kota Yogyakarta 1 Oktober 1965 pukul 15.00 Kolonel Katamso mengadakan pertemuan dengan staf yang bertempat di rumah Kolonel Katamso. Pertemuan membahas tentang perkembangan situasi yang terjadi di Yogyakarta dan sekitarnya. Kemudian pukul 17.00 datang dua truk dan satu jeep berisi anggota Batalyon L masuk pekarangan rumah Kolonel Katamso. Pasukan yang datang menodongkan senjata memerintahkan kepada Kolonel Katamso agar ikut mereka, dan ternyata Kolonel Katamso diculik dan kemudian di bunuh. Jenazah ditemukan di Kompleks Batalyon L Kentungan, Sleman Yogyakarta. Bersama Kolonel Katamso ditemukan juga jenazah Letkol Sugiyono.