TGP Yogyakarta terbentuk pada tanggal 12 Februari 1947 , yang kemudian masuk ke dalam datasemen VI TGP Yogya. Setelah ada Reorganisasi dan Rasionalisasi (Rera) pada tahun 1948 seluruh satuan pelajar pejuang bersenjata digabungkan menjadi satu dalam Brigade III Siliwangi, dan tidak lama kemudian berubah lagi menjadi KRU W , kemudian menjelma menjadi Brigade XVII , dan Datasemen VI TGP Yogya berubah menjadi Kompi IV TGP Yogyakarta. TGP Yogyakarta sebagai kesatuan zeni memiliki tiga unsur penting untuk menunjang tugasnya, yakni seksi pioner, seksi fabricase, dan seksi PHB (perhubungan).